提取rna取上清液过程,浓盐法提取rna

  

  先说支原体的常规检测方法。   

  

  养细胞的朋友最怕的恐怕就是细胞污染了。   

  

  这种细菌和真菌的污染很容易分辨,虽然处理起来比较麻烦,但也不是不可能。相比较而言,支原体污染防不胜防。   

  

     

  

  显微镜很难捕捉到它们。它们和细胞在同一个培养体系中共存,也和细胞抢食抢饮。可怜无助的细胞根本不是支原体的对手。他们只能生存,状态不如一代人,导致实验结果出现偏差。   

  

     

  

  大多数情况下,如果发现细胞被支原体污染,直接扔掉,清理环境就行了。但在一些特殊实验中,如细胞种子保存、抗体药物生产、疫苗生产或细胞治疗等,需要常规检测细胞中的支原体,以保证细胞的纯度。   

  

  支原体常规检测法之经典法   

  

  这是指基于经典方法试剂盒的检测方法:VenorGem qEP。   

  

     

  

  每个人都应该熟悉qPCR:   

  

  实时荧光定量PCR   

  

  定量实时PCR   

  

     

  

  这是一种在DNA扩增中使用荧光化学物质在聚合酶链式反应(PCR)的每个循环后测量产物总量的方法。通过内部或外部参照方法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析。   

  

  在经典的支原体检测试剂盒中,不需要提取RNA和逆转录,样品只需要待检测的细胞上清液或从上清液中提取的DNA。   

  

  经典法试剂盒:VenorGem qEP使用方法   

  

  一、样品制备:   

  

  浓缩:当细胞生长至90%时,可收集上清液用于检测,并可适当浓缩样品。   

  

  注意:浓缩只适用于支原体的完整性,避免浓缩前支原体被破坏(如热灭活)。   

  

     

  

  稳定:细胞培养样品中可能含有丰富的DNA酶,它们能在低温下降解支原体DNA。因此,建议稳定样品。如果立即进行DNA提取,则忽略该步骤。   

  

     

  

  DNA 抽提:的大量证据表明,DNA提取可以达到最高的灵敏度。DNA提取的方法有很多,但要适合支原体基因组。我们建议:   

  

  VenorGeM Sample Preparation kits (货号56-1010/-1050/-1200) 适合手动DNA抽提   

  

  这些DNA提取试剂盒都经过了广泛的验证,具体流程见试剂盒说明书。此外,VenorGeM qEP试剂盒中包含的内控DNA质控品也用于验证DNA提取步骤(内控原理:已知浓度的细胞中含有内控DNA序列,该序列与任何现有的生物序列均不同源,对检测的DNA样品干扰最小。在DNA提取之前,将内部对照细胞和样品加入到细胞裂解溶液中并一起提取。内部对照DNA序列的成功扩增表明目标DNA的成功提取)。   

  

  二、试剂制备与PCR   

  

     

  

  注:具体参数设置请点击阅读原文,登录官网查询。   

  

  此外,以下仪器已通过PCR反应验证:   

  

     

  

  三、试剂制备与PCR   

  

  FAM通道用于检测支原体荧光信号。根据DNA标准曲线和Ct值。具体步骤请参考具体qPCR仪器和软件的功能。我们建议评估包括质控品在内的每个样品的扩增曲线。   

  

  CT & lt40是阳性。Ct40为阴性。支原体DNA和内参DNA对信号有竞争性抑制作用。支原体DNA越多,FAM通道信号越高,而内部对照的HEX通道信号越低。   

  

     

  

  今天在这里介绍检测支原体的经典qPCR方法。   

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