1、定义不同
总股本，包括新股发行前的股份和新发行的股份的数量的总和。总股本亦作资本总额。公司资产的总价值，包括股本金、长期债务及经营盈余所形成的资产。
流通股是指上市公司股份中，可以在交易所流通的股份数量。其概念，是相对于证券市场而言的。在可流通的股票中，按市场属性的不同可分为A股、B股、法人股和境外上市股。
2、关系不同
总股本包适限售股和流通股，限售股也是有主的，可能是个人持有，也可能是投资机构等，流通股指可在二级市场交易的股票。
总股本是股份公司发行的全部股票所占的股份总数，流通股本可能只是其中的一部分，对于全流通股份来说总股本＝流通股本。
3、流通性质不同
流通股本是指公司已发行股本中在外流通没有被公司收回的部分。是指可以在二级市场流通的股份。
外国的股票从一上市就是全流通的，总股本就等于流通股本。而中国的股票上市，在未实行股权分置改革前，法人股是不允许上市流通的，只有部份发行的股票可在二级市场流通，这部份就是所谓的流通股本。
开始实施股权分置改革后，新上市的股票都是全流通的，过去的法人股也慢慢可以开始在二级市场流通，但却是有数量和时间限制，这就是限售流通股，因为监管部门担心一下子那么多的股票上市，必然会导致资金承接不住而崩盘。慢慢的，中国股市将实现真正的全流通，总股本也就等于流通股了。
流通股本是总股本的一部分。
总股本是新股发行前的股份数量与新发行的股份数量之和，也就是总股本是一个工资的资本总额，而流通股本是指在证券市场内进行流通且可以用于交易的股票数量。两者直接的关系是包含关系，总股本包含流通股本与非流通股本，流通股本只是总股本的一部分。
在极特殊的情况下，全流通的总股本与流通股本相同。一个上市公司的总股本如果过大，而流通的股本又太小的话，那么这只股票的股价波动不会很大。而总股本小，流通股本比例大的话，比较容易让庄家建仓，从而使股价剧烈波动。
流通A股是可以在市场上买卖的股份，但是其中有限售流通股；
限售流通股其实就相当于非流通股，有两种情况，一种是在战略投资者通过定向增发投资某上市公司的时候，由于其战略目的持股时间要超过一般投资者，而且往往定向发行价格要低于当前的市场价格，因此要求锁定该股份于一定的期限；
另一种情况，在股权分置改革下，非流通股在支付股改对价后摇身变成流通股需要一个过渡期，一般禁售期为一年，一年后可以按比例流通出售，这个期限内也是限售流通股；
总股本，包括新股发行前的股份和新发行的股份的数量的总和。商务印书馆《英汉证券投资词典》解释:总股本 capitalization。亦作:资本总额。公司资产的总价值，包括股本金、长期债务及经营盈余所形成的资产。
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